Селото е възникнало като турски чифлик, затова в турски регистър преди Освобождението е записано като Селями чифлик. Тогава то е имало 30 домакинства. След Освобождението с. Ягодово взема името на българина Янчо, който е бил управител на воденицата и имотите на чифлика, и става Янчев чифлик. С Указ № 334 от 13 юли 1951 г. селото е преименувано на Ягодово, тъй като основният му поминък тогава е ягодарството.

Днес Ягодово е благоустроено село. На 1 км над него се издига стената на яз. Среченска бара. Водата в язовира се събира чрез канали от реките Бързия, Врещица и други извори. Пътят извива край язовира. Вдясно на билото минава шосе, което над Клисурския манастир прави връзка с шосето за Вършец. Оттук се виждат вр. Тодорини кукли.